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750 次 時空組學研究進展（二)：單細胞RNA測序數(shù)據(jù)的分析方法 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0scRNA-seq 的原始數(shù)據(jù)格式和目前大多數(shù)scRNA-seq 分析過程都基于 FASTQ 文件（或壓縮格式 fq.gz）。Illumina 平臺測序數(shù)據(jù)默認生成 BCL 格式文件
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1181 次 時空組學研究進展（一）：單細胞RNA測序的流程與技術 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0單細胞測序概述單細胞測序（Single-cell RNA sequencing; scRNA-seq）是一種開創(chuàng)性的單細胞測序技術，現(xiàn)在已得到廣泛普及，并涵蓋了多種方法。盡
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967 次 DAP-seq助力揭示SmHSFA8調(diào)控茄子耐熱性機制 2024-12-23
2024年12月17日，華南農(nóng)業(yè)大學園藝學院曹必好教授團隊在Plant, Cell & Environment（中科院一區(qū)Top期刊，影響因子7.6）在線發(fā)表了題為SmHSFA8 enhances the heat tolerance of eggplant by
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935 次 基因沙漠：調(diào)控Shox2基因多效性表達與胚胎發(fā)育的關鍵區(qū)域 2024-11-20
文章題目：A gene desert required for regulatory control of pleiotropic Shox2 expression and embryonic survival發(fā)表時間：2024.10.10發(fā)表平臺：Nature Communications影響因子：IF 14.7 Q
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1170 次 DAP-seq助力揭示番茄抗酸鋁分子調(diào)控新機制 2024-10-23
2024年10月2日，云南農(nóng)業(yè)大學園林園藝學院營養(yǎng)逆境與品質(zhì)改良楊建立/范偉團隊在Horticulture Research期刊(IF=7.6)上在線發(fā)表題為“SlSTOP1-regulated SlHAK5 expression confers Al toler
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951 次 RNA Pull Down和RIP的技術應用 2024-10-15
RNA Pull Down和RIP的技術應用：ELF18誘導的lncRNA ELENA1與MED19a互作增強擬南芥免疫反應植物和動物在自然環(huán)境中都面臨著被各種微生物感染的風險。與動物一樣，植物也演化出了一套模式識別受體
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1058 次 Sfrp1抑制肺成纖維細胞向損傷誘導的肌成纖維細胞轉(zhuǎn)變期間的侵襲 2024-10-15
期刊：European Respiratory Journal影響因子：16.6主要技術：scRNA-seq；空間轉(zhuǎn)錄組；成纖維細胞導語組織纖維化是大多數(shù)主要慢性疾病中最大的未解決的臨床問題之一，產(chǎn)生細胞外基質(zhì)（ECM）的肌
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1338 次 蛋白質(zhì)與RNA互作研究新技術：RNA親和純化測序（RAP-seq） 2024-10-10
蛋白質(zhì)和RNA是具有緊密關系的生物分子，能夠通過物理相互作用參與完成細胞的周期并調(diào)控細胞的生物學過程。如果干擾了它們的正常相互作用，將會導致細胞功能障礙和疾病發(fā)生。因此，研究RNA與蛋白
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953 次 DAP-seq助力揭示GhSBI1調(diào)控棉花果枝節(jié)間伸長的分子機制 2024-10-9
2024年7月26日，中國農(nóng)業(yè)科學院棉花研究所張永山研究員團隊在Plant Biotechnology Journal（影響因子10.1）雜志上發(fā)表了題為“GhSBI1, a CUP-SHAPED COTYLEDON 2 homologue, modulates bra
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959 次 利用染色質(zhì)免疫共沉淀測序技術ChIP-seq等揭示頭頸鱗癌免疫逃逸機制 2024-10-9
免疫逃逸是癌癥進展的關鍵里程碑，是腫瘤免疫治療的理論基礎。頭頸部鱗狀細胞癌（(head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)）是全球最常見的惡性腫瘤之一，傳統(tǒng)治療選擇包括手術切除、放
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1230 次 ChIP-seq等揭示Foxo1-YAP-Notch1軸在疾病進展中的表觀調(diào)控作用 2024-8-27
大家好，這里是專注表觀組學十余年，領跑多組學科研服務的易基因。非酒精性脂肪性肝炎（nonalcoholic steatohepatitis，NASH）是一種慢性肝臟疾病，其特征是肝臟中脂肪積累、炎癥和纖維化。干擾
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999 次 植物組學時代的DNA甲基化研究在群體表觀遺傳學中的應用 2024-8-20
DNA甲基化在許多生物過程中發(fā)揮著重要作用。得益于數(shù)十年來對DNA甲基化突變體的研究，如今對DNA甲基化的建立和維持機制有了很好的理解，尤其在擬南芥（Arabidopsis thaliana）的Col-0品系中的研
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2507 次 微生物遺傳研究利器Tn-Seq轉(zhuǎn)座子測序技術的介紹與技術流程 2024-7-8
轉(zhuǎn)座子測序簡介轉(zhuǎn)座子(transposon,Tn)是存在于染色體DNA上可自主復制和位移的基本單位，在細菌的染色體、質(zhì)�；蚴删w之間可以自行移動，通過切割、整合等過程從基因組的一個位置“跳躍&rd
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841 次 DAP-seq技術助力揭示MdWRKY75調(diào)控蘋果耐熱性的分子機制 2024-7-4
2024年6月12日，西北農(nóng)林科技大學作物抗逆與高效生產(chǎn)全國重點實驗室/園藝學院蘋果抗逆與品質(zhì)改良創(chuàng)新團隊馬鋒旺教授/李超課題組在植物學知名期刊The Plant Cell（影響因子10）在線發(fā)表了題為&ld
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1260 次 seq-DAP-seq和ChIP-seq聯(lián)合檢測揭示花發(fā)育器官轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控機制 2024-6-28
技術簡介MADS轉(zhuǎn)錄因子的同源蛋白SEPALLATA3 (SEP3)和AGAMOUS (AG)是調(diào)控擬南芥花發(fā)育分化的重要DNA結(jié)合蛋白。在雌蕊發(fā)育階段，SEP3和AG形成異源四聚體，通過識別CArG-box序列來調(diào)控基因的表達。
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724 次 Ribo-seq與RNA-seq聯(lián)合分析揭示uAUG-ds翻譯調(diào)控機制 2024-6-25
技術簡介RNA-seq主要從轉(zhuǎn)錄組水平分析基因的表達調(diào)控機制，檢測用于核糖體翻譯的RNA序列及二級結(jié)構。Ribo-seq主要用于檢測核糖體翻譯的起始位置、翻譯富集區(qū)和翻譯終止位置。RNA-seq與Ribo-seq聯(lián)
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1145 次 空間轉(zhuǎn)錄組學在揭示獨特和保守的腫瘤核心和邊緣結(jié)構中的應用 2024-6-12
期刊：Nature Communications影響因子：16.6主要技術：ScRNA-seq、ST導語腫瘤微環(huán)境的空間組織對生物學和治療反應有著深遠的影響。對hpv陰性口腔鱗狀細胞癌(OSCC)進行了單細胞和空間轉(zhuǎn)錄組學分析
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917 次 基于翻譯組學技術揭示小麥籽粒發(fā)育過程中的翻譯調(diào)控機制 2024-6-6
2023年發(fā)表在The Plant Cell上的“The translational landscape of bread wheat during grain development”文章，發(fā)現(xiàn)了上游開放閱讀框（uORFs）、下游開放閱讀框（dORFs）和長鏈非編
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1105 次 應用DAP-seq技術助力揭示GhRCD1促進棉花對鎘的耐受能力 2024-4-29
鎘（Cd2+）是環(huán)境中最常見的有害重金屬之一，嚴重威脅作物生產(chǎn)力和質(zhì)量以及食品安全。Cd2+容易被植物從土壤中吸收，并通過可食用的植物器官和谷物進入食物鏈，對食品質(zhì)量、糧食安全和公共安全構
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1056 次 DAP-seq助力揭示轉(zhuǎn)錄因子在草地貪夜蛾Bt抗性中重要作用 2024-4-25
2024年4月6日，武漢生物工程學院生命科學與技術學院劉磊磊課題組在International Journal of Biological Macromolecules（中科院一區(qū)，影響因子8.2）期刊在線發(fā)表了“Contribution of the
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