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748 次 時(shí)空組學(xué)研究進(jìn)展（二)：?jiǎn)渭?xì)胞RNA測(cè)序數(shù)據(jù)的分析方法 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0scRNA-seq 的原始數(shù)據(jù)格式和目前大多數(shù)scRNA-seq 分析過(guò)程都基于 FASTQ 文件（或壓縮格式 fq.gz）。Illumina 平臺(tái)測(cè)序數(shù)據(jù)默認(rèn)生成 BCL 格式文件
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1178 次 時(shí)空組學(xué)研究進(jìn)展（一）：?jiǎn)渭?xì)胞RNA測(cè)序的流程與技術(shù) 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0單細(xì)胞測(cè)序概述單細(xì)胞測(cè)序（Single-cell RNA sequencing; scRNA-seq）是一種開(kāi)創(chuàng)性的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)，現(xiàn)在已得到廣泛普及，并涵蓋了多種方法。盡
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963 次 DAP-seq助力揭示SmHSFA8調(diào)控茄子耐熱性機(jī)制 2024-12-23
2024年12月17日，華南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院曹必好教授團(tuán)隊(duì)在Plant, Cell & Environment（中科院一區(qū)Top期刊，影響因子7.6）在線(xiàn)發(fā)表了題為SmHSFA8 enhances the heat tolerance of eggplant by
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933 次 基因沙漠：調(diào)控Shox2基因多效性表達(dá)與胚胎發(fā)育的關(guān)鍵區(qū)域 2024-11-20
文章題目：A gene desert required for regulatory control of pleiotropic Shox2 expression and embryonic survival發(fā)表時(shí)間：2024.10.10發(fā)表平臺(tái)：Nature Communications影響因子：IF 14.7 Q
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1167 次 DAP-seq助力揭示番茄抗酸鋁分子調(diào)控新機(jī)制 2024-10-23
2024年10月2日，云南農(nóng)業(yè)大學(xué)園林園藝學(xué)院營(yíng)養(yǎng)逆境與品質(zhì)改良楊建立/范偉團(tuán)隊(duì)在Horticulture Research期刊(IF=7.6)上在線(xiàn)發(fā)表題為“SlSTOP1-regulated SlHAK5 expression confers Al toler
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948 次 RNA Pull Down和RIP的技術(shù)應(yīng)用 2024-10-15
RNA Pull Down和RIP的技術(shù)應(yīng)用：ELF18誘導(dǎo)的lncRNA ELENA1與MED19a互作增強(qiáng)擬南芥免疫反應(yīng)植物和動(dòng)物在自然環(huán)境中都面臨著被各種微生物感染的風(fēng)險(xiǎn)。與動(dòng)物一樣，植物也演化出了一套模式識(shí)別受體
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1052 次 Sfrp1抑制肺成纖維細(xì)胞向損傷誘導(dǎo)的肌成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)變期間的侵襲 2024-10-15
期刊：European Respiratory Journal影響因子：16.6主要技術(shù)：scRNA-seq；空間轉(zhuǎn)錄組；成纖維細(xì)胞導(dǎo)語(yǔ)組織纖維化是大多數(shù)主要慢性疾病中最大的未解決的臨床問(wèn)題之一，產(chǎn)生細(xì)胞外基質(zhì)（ECM）的肌
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1335 次 蛋白質(zhì)與RNA互作研究新技術(shù)：RNA親和純化測(cè)序（RAP-seq） 2024-10-10
蛋白質(zhì)和RNA是具有緊密關(guān)系的生物分子，能夠通過(guò)物理相互作用參與完成細(xì)胞的周期并調(diào)控細(xì)胞的生物學(xué)過(guò)程。如果干擾了它們的正常相互作用，將會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞功能障礙和疾病發(fā)生。因此，研究RNA與蛋白
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951 次 DAP-seq助力揭示GhSBI1調(diào)控棉花果枝節(jié)間伸長(zhǎng)的分子機(jī)制 2024-10-9
2024年7月26日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所張永山研究員團(tuán)隊(duì)在Plant Biotechnology Journal（影響因子10.1）雜志上發(fā)表了題為“GhSBI1, a CUP-SHAPED COTYLEDON 2 homologue, modulates bra
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958 次 利用染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序技術(shù)ChIP-seq等揭示頭頸鱗癌免疫逃逸機(jī)制 2024-10-9
免疫逃逸是癌癥進(jìn)展的關(guān)鍵里程碑，是腫瘤免疫治療的理論基礎(chǔ)。頭頸部鱗狀細(xì)胞癌（(head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)）是全球最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一，傳統(tǒng)治療選擇包括手術(shù)切除、放
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1228 次 ChIP-seq等揭示Foxo1-YAP-Notch1軸在疾病進(jìn)展中的表觀調(diào)控作用 2024-8-27
大家好，這里是專(zhuān)注表觀組學(xué)十余年，領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)的易基因。非酒精性脂肪性肝炎（nonalcoholic steatohepatitis，NASH）是一種慢性肝臟疾病，其特征是肝臟中脂肪積累、炎癥和纖維化。干擾
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996 次 植物組學(xué)時(shí)代的DNA甲基化研究在群體表觀遺傳學(xué)中的應(yīng)用 2024-8-20
DNA甲基化在許多生物過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。得益于數(shù)十年來(lái)對(duì)DNA甲基化突變體的研究，如今對(duì)DNA甲基化的建立和維持機(jī)制有了很好的理解，尤其在擬南芥（Arabidopsis thaliana）的Col-0品系中的研
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2503 次 微生物遺傳研究利器Tn-Seq轉(zhuǎn)座子測(cè)序技術(shù)的介紹與技術(shù)流程 2024-7-8
轉(zhuǎn)座子測(cè)序簡(jiǎn)介轉(zhuǎn)座子(transposon,Tn)是存在于染色體DNA上可自主復(fù)制和位移的基本單位，在細(xì)菌的染色體、質(zhì)粒或噬菌體之間可以自行移動(dòng)，通過(guò)切割、整合等過(guò)程從基因組的一個(gè)位置“跳躍&rd
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840 次 DAP-seq技術(shù)助力揭示MdWRKY75調(diào)控蘋(píng)果耐熱性的分子機(jī)制 2024-7-4
2024年6月12日，西北農(nóng)林科技大學(xué)作物抗逆與高效生產(chǎn)全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/園藝學(xué)院蘋(píng)果抗逆與品質(zhì)改良創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)馬鋒旺教授/李超課題組在植物學(xué)知名期刊The Plant Cell（影響因子10）在線(xiàn)發(fā)表了題為&ld
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1259 次 seq-DAP-seq和ChIP-seq聯(lián)合檢測(cè)揭示花發(fā)育器官轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控機(jī)制 2024-6-28
技術(shù)簡(jiǎn)介MADS轉(zhuǎn)錄因子的同源蛋白SEPALLATA3 (SEP3)和AGAMOUS (AG)是調(diào)控?cái)M南芥花發(fā)育分化的重要DNA結(jié)合蛋白。在雌蕊發(fā)育階段，SEP3和AG形成異源四聚體，通過(guò)識(shí)別CArG-box序列來(lái)調(diào)控基因的表達(dá)。
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720 次 Ribo-seq與RNA-seq聯(lián)合分析揭示uAUG-ds翻譯調(diào)控機(jī)制 2024-6-25
技術(shù)簡(jiǎn)介RNA-seq主要從轉(zhuǎn)錄組水平分析基因的表達(dá)調(diào)控機(jī)制，檢測(cè)用于核糖體翻譯的RNA序列及二級(jí)結(jié)構(gòu)。Ribo-seq主要用于檢測(cè)核糖體翻譯的起始位置、翻譯富集區(qū)和翻譯終止位置。RNA-seq與Ribo-seq聯(lián)
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1143 次 空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)在揭示獨(dú)特和保守的腫瘤核心和邊緣結(jié)構(gòu)中的應(yīng)用 2024-6-12
期刊：Nature Communications影響因子：16.6主要技術(shù)：ScRNA-seq、ST導(dǎo)語(yǔ)腫瘤微環(huán)境的空間組織對(duì)生物學(xué)和治療反應(yīng)有著深遠(yuǎn)的影響。對(duì)hpv陰性口腔鱗狀細(xì)胞癌(OSCC)進(jìn)行了單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
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915 次 基于翻譯組學(xué)技術(shù)揭示小麥籽粒發(fā)育過(guò)程中的翻譯調(diào)控機(jī)制 2024-6-6
2023年發(fā)表在The Plant Cell上的“The translational landscape of bread wheat during grain development”文章，發(fā)現(xiàn)了上游開(kāi)放閱讀框（uORFs）、下游開(kāi)放閱讀框（dORFs）和長(zhǎng)鏈非編
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1101 次 應(yīng)用DAP-seq技術(shù)助力揭示GhRCD1促進(jìn)棉花對(duì)鎘的耐受能力 2024-4-29
鎘（Cd2+）是環(huán)境中最常見(jiàn)的有害重金屬之一，嚴(yán)重威脅作物生產(chǎn)力和質(zhì)量以及食品安全。Cd2+容易被植物從土壤中吸收，并通過(guò)可食用的植物器官和谷物進(jìn)入食物鏈，對(duì)食品質(zhì)量、糧食安全和公共安全構(gòu)
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1054 次 DAP-seq助力揭示轉(zhuǎn)錄因子在草地貪夜蛾Bt抗性中重要作用 2024-4-25
2024年4月6日，武漢生物工程學(xué)院生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院劉磊磊課題組在International Journal of Biological Macromolecules（中科院一區(qū)，影響因子8.2）期刊在線(xiàn)發(fā)表了“Contribution of the
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