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PacBio HiFi測(cè)序全國(guó)巡演活動(dòng)(上海站)圓滿結(jié)束

瀏覽次數(shù):1369 發(fā)布日期:2023-6-10  來(lái)源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處
Blue Pippin 全自動(dòng)DNA脈沖場(chǎng)電泳回收儀助力PacBio HiFi測(cè)序

2023年6月1日,PacBio在上海交通大學(xué)Bio-X研究院舉辦了“PacBio HiFi測(cè)序全國(guó)巡演活動(dòng)——上海場(chǎng)”。

PacBio專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)及交大該領(lǐng)域的專家學(xué)者,為大家奉獻(xiàn)了精彩的學(xué)術(shù)報(bào)告,主要內(nèi)容包括PacBio HiFi測(cè)序技術(shù)更新,PacBio HiFi測(cè)序應(yīng)用最新進(jìn)展,以及HiFi測(cè)序技術(shù)如何提供準(zhǔn)確和可行的全基因組解決方案。 

會(huì)議精彩縮影:


上海交通大學(xué)Bio-X研究院院長(zhǎng)師詠勇教授歡迎致辭


PacBio技術(shù)人員介紹PacBio長(zhǎng)片段測(cè)序特點(diǎn)
 

PacBio技術(shù)人員介紹Revio自動(dòng)化測(cè)序平臺(tái)
 
PacBio公司在會(huì)議上隆重介紹了近期推出的Revio自動(dòng)化測(cè)序平臺(tái)。Revio平臺(tái)作為最新一代的高通量長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序系統(tǒng),采用了25M SMRTcell,每次可以并行檢測(cè)4張芯片,提供每年以30X覆蓋率、多達(dá)1300個(gè)人類全基因組進(jìn)行測(cè)序的能力。上海交通大學(xué)Bio-X研究院引入全國(guó)首臺(tái)高校級(jí)PacBio Revio測(cè)序平臺(tái),為科研人員提供了先進(jìn)的基因組測(cè)序工具,助力生命科學(xué)研究,進(jìn)一步凸顯Bio-X研究院生命科學(xué)研究實(shí)力。

Revio平臺(tái)采用了PacBio獨(dú)有的HiFi 測(cè)序技術(shù),這種測(cè)序方法克服了傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)的局限性,可同時(shí)實(shí)現(xiàn)長(zhǎng)讀長(zhǎng)和高準(zhǔn)確度的測(cè)序。因此,該平臺(tái)可實(shí)現(xiàn)解析復(fù)雜的基因組區(qū)域、檢測(cè)結(jié)構(gòu)變異、揭示罕見(jiàn)變異和研究表觀遺傳學(xué)等,在各個(gè)領(lǐng)域的應(yīng)用前景也非常廣闊。長(zhǎng)讀長(zhǎng)使其能夠有效解析復(fù)雜的基因組結(jié)構(gòu),包括短讀測(cè)序技術(shù)難以實(shí)現(xiàn)的高度重復(fù)的基因區(qū)域和基因組結(jié)構(gòu)變異。高準(zhǔn)確性也使得它能夠發(fā)現(xiàn)短讀測(cè)序技術(shù)可能錯(cuò)過(guò)的罕見(jiàn)變異,為精準(zhǔn)醫(yī)療等提供更精確的基因變異信息。

為了確保HiFi測(cè)序能夠?qū)崿F(xiàn)長(zhǎng)讀長(zhǎng)和高準(zhǔn)確性,其測(cè)序文庫(kù)需要去除小片段(<10kb),將文庫(kù)大小限制在15-18kb范圍內(nèi)。該精準(zhǔn)的文庫(kù)要求,可確保測(cè)序數(shù)據(jù)的高質(zhì)量,也印證了片段篩選是PacBio HiFi測(cè)序的關(guān)鍵步驟。然而在片段篩選環(huán)節(jié),常規(guī)的磁珠篩選法無(wú)法去除干凈小片段,也無(wú)法精準(zhǔn)控制回收范圍,大大影響了測(cè)序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和產(chǎn)量。美國(guó)Sage Science公司的脈沖場(chǎng)電泳全自動(dòng)DNA片段回收儀,可滿足上述需求,已成為HiFi文庫(kù)構(gòu)建的金標(biāo)準(zhǔn)和建庫(kù)必備工具。

美國(guó)Sage Science公司擁有行業(yè)領(lǐng)先的DNA片段回收技術(shù),其研發(fā)制造的Pippin系列全自動(dòng)核酸電泳片段回收儀,采用了脈沖場(chǎng)電泳原理,可精準(zhǔn)回收常規(guī)直流電泳無(wú)法有效分離的大分子DNA。此外,Sage Science公司擁有多項(xiàng)DNA片段回收相關(guān)美國(guó)技術(shù)專利,其Pippin系列產(chǎn)品可高效完成不同長(zhǎng)度范圍的DNA片段的精準(zhǔn)回收,廣泛用于二代測(cè)序、三代測(cè)序的文庫(kù)構(gòu)建以及多種分子生物學(xué)相關(guān)領(lǐng)域。此外,Sage Science最近推出了新的篩選模式“Range+T”,結(jié)合相應(yīng)的預(yù)制膠試劑盒,進(jìn)一步提高了9-30kb范圍內(nèi)片段篩選的分辨率,從而助力PacBio HiFi 測(cè)序獲取質(zhì)量更高的測(cè)序數(shù)據(jù)。

圖示:“Range+T”模式回收的精確性
回收起點(diǎn)設(shè)置為15kb,設(shè)置不同回收時(shí)間,結(jié)果顯示所有泳道回收起點(diǎn)一致,不同回收時(shí)間得到不同長(zhǎng)度范圍的文庫(kù)

環(huán)亞生物科技有限公司作為美國(guó)Sage Science公司在中國(guó)區(qū)的獨(dú)家代理商,自2011年以來(lái)將Sage Science的產(chǎn)品線引入國(guó)內(nèi),一直為國(guó)內(nèi)用戶提供專業(yè)的全自動(dòng)核酸片段回收系統(tǒng)的安裝測(cè)試、應(yīng)用培訓(xùn),技術(shù)支持與售后維護(hù)工作,贏得客戶的一致好評(píng)與信任。來(lái)自Sage Science的Blue Pippin 全自動(dòng)DNA脈沖場(chǎng)電泳回收儀,通過(guò)對(duì)大片段核酸的精準(zhǔn)回收,助力PacBio HiFi測(cè)序開創(chuàng)三代測(cè)序新紀(jì)元。

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