AVATAR系統(tǒng)應(yīng)用:低氧條件下膠質(zhì)母細(xì)胞瘤代謝表型研究
瀏覽次數(shù):424 發(fā)布日期:2025-7-22
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《Nature Metabolism》近期發(fā)布的一項研究通過多模態(tài)技術(shù)整合,首次證實膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(Glioblastoma, GB)代謝異質(zhì)性主要由細(xì)胞內(nèi)在因素驅(qū)動,挑戰(zhàn)了微環(huán)境主導(dǎo)的傳統(tǒng)認(rèn)知。研究團隊通過整合¹³C標(biāo)記葡萄糖輸注患者的質(zhì)譜成像、空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),并結(jié)合體外低氧培養(yǎng)及異種移植模型,系統(tǒng)分析了糖酵解型(高糖酵解低TCA循環(huán)活性)、氧化型(低糖酵解高TCA循環(huán)活性)及混合型(雙低活性)三種代謝表型的決定因素。研究創(chuàng)新性地采用美國XCellbio公司開發(fā)的AVATAR低氧培養(yǎng)系統(tǒng),對GB患者來源的神經(jīng)球進行為期160小時的0.5% O₂濃度培養(yǎng),以評估低氧微環(huán)境對代謝表型的影響。
AVATAR個體化細(xì)胞控制系統(tǒng)
實驗結(jié)果顯示,在AVATAR系統(tǒng)模擬的0.5% O₂低氧條件下,即使經(jīng)過160小時培養(yǎng),GB細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組和代謝特征仍保持穩(wěn)定,未檢測到適應(yīng)性代謝重編程。這一關(guān)鍵發(fā)現(xiàn)證實了GB代謝亞型(如糖酵解型、氧化型)主要由細(xì)胞內(nèi)在因素決定,并具有穩(wěn)定的生物學(xué)特性。該研究不僅闡明了GB代謝異質(zhì)性的細(xì)胞自主性調(diào)控機制,凸顯了AVATAR系統(tǒng)在精確模擬腫瘤微環(huán)境和解析細(xì)胞固有代謝特征中的重要價值,為膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的代謝研究提供了新的理論依據(jù)和技術(shù)支撐。

實驗方法
研究團隊對三名膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者在手術(shù)前靜脈輸注[U-¹³C]葡萄糖,隨后通過快速冷凍保存腫瘤組織樣本。質(zhì)譜成像(DESI-MSI和MALDI-MSI)用于分析腫瘤代謝活性,同時結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(10X Genomics Visium平臺)和成像質(zhì)譜流式技術(shù)(IMC)對腫瘤微環(huán)境進行表征;颊邅碓吹纳窠(jīng)球在體外培養(yǎng),并使用Matrigel基質(zhì)膠包埋形成球體,部分神經(jīng)球在低氧條件(0.5% O₂)下培養(yǎng),實驗中使用AVATAR(XCellbio)系統(tǒng)精確控制低氧環(huán)境。數(shù)據(jù)分析采用SCILS Lab、R和GraphPad Prism等軟件,并通過嚴(yán)格的統(tǒng)計方法確保結(jié)果的可信度。
實驗結(jié)果
1. 正常腦皮質(zhì)與膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GB)的代謝特征
通過質(zhì)譜成像(MSI)分析,膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GB)與正常腦組織在代謝特征上存在顯著差異。如圖1h所示,GB1中[U-¹³C]乳酸信號顯著低于GB2(P<0.0001),而[¹³C2]谷氨酸信號高于轉(zhuǎn)移瘤(P=0.0394),反映了轉(zhuǎn)移瘤中更高的糖酵解和更低的TCA循環(huán)活性。GB腫瘤中的谷氨酸標(biāo)記與正常大腦中的標(biāo)記相當(dāng)。這些結(jié)果揭示了GB腫瘤代謝的異質(zhì)性。
圖1.術(shù)中冷凍可迅速阻滯組織代謝并實現(xiàn)代謝活動的可視化
2. 代謝物13C標(biāo)記揭示膠質(zhì)母細(xì)胞瘤代謝表型
研究團隊通過基于7種¹³C標(biāo)記代謝物(糖酵解途徑和TCA循環(huán))的k-means聚類分析,在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GB)中鑒定出三種由腫瘤細(xì)胞自身決定的固有代謝表型:糖酵解型(狀態(tài)3:高糖酵解低TCA循環(huán)活性)、氧化型(狀態(tài)2:低糖酵解高TCA循環(huán)活性)以及混合型(狀態(tài)1:兩種途徑活性均低)。值得注意的是,雖然GB1以氧化表型(狀態(tài)2)為主,GB2以糖酵解表型(狀態(tài)3)為主,但兩種腫瘤內(nèi)部均同時存在這三種代謝區(qū)域(圖2b)?臻g轉(zhuǎn)錄組分析進一步驗證了這些代謝表型,與MSI數(shù)據(jù)顯示出65%的一致性(圖2c)。這些結(jié)果表明GB腫瘤具有顯著的代謝異質(zhì)性,且不同代謝表型在空間上形成明確分界的大區(qū)域,這種分布模式可能為臨床代謝成像提供可行性基礎(chǔ)。
圖2.膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GB)組織切片中代謝表型的鑒定
3. 代謝表型與微環(huán)境無顯著相關(guān)性
實驗結(jié)果表明,膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GB)的代謝表型(糖酵解型、氧化型和混合型)與腫瘤微環(huán)境(TME)的特征無顯著相關(guān)性。通過質(zhì)譜成像(MSI)和空間轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn),不同代謝表型區(qū)域的能量狀態(tài)(ATP/ADP、PCr/ATP比值)、氧化還原水平(AsA/DHA、GSH/GSSG、乳酸/丙酮酸比值)以及微環(huán)境特征(免疫細(xì)胞浸潤、增殖標(biāo)志物Ki67表達、血管密度)均無顯著差異(圖2d、2e)。此外,壞死區(qū)域或與血管的距離也未影響代謝表型的分布?臻g轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進一步證明,惡性細(xì)胞主導(dǎo)區(qū)域可同時存在三種代謝狀態(tài),而免疫細(xì)胞富集區(qū)多呈糖酵解表型,神經(jīng)元區(qū)域則以氧化型為主(圖2g-i)。關(guān)鍵的是,低氧標(biāo)志物CAIX表達及各類微環(huán)境細(xì)胞群在不同代謝區(qū)間無差異。這些證據(jù)共同表明,GB的代謝異質(zhì)性主要源于腫瘤細(xì)胞自身固有的代謝重編程,而非微環(huán)境因素驅(qū)動。
4. 代謝表型與血管分布無顯著關(guān)聯(lián)
通過篩選大血管(膠原蛋白I+與αSMA+標(biāo)記),并將其與連續(xù)質(zhì)譜成像切片進行共定位,以65微米為間隔從血管腔向外測量¹³C標(biāo)記的糖酵解和三羧酸循環(huán)代謝物。結(jié)果顯示:無論距離血管遠近,乳酸和谷氨酸標(biāo)記水平、Ki67+染色所示的增殖細(xì)胞數(shù)量、NADPH/NADP+比值(AsA:DHA比值)或NADH/NAD+比值([U-¹³C]乳酸/[U-¹³C]丙酮酸比值)均無差異。然而,隨著與血管壁距離的增加,免疫細(xì)胞數(shù)量呈下降趨勢。這些數(shù)據(jù)表明,GB腫瘤細(xì)胞的代謝特征不受局部血管供應(yīng)的顯著影響,進一步支持了代謝表型的細(xì)胞固有性,而非由血管微環(huán)境驅(qū)動的結(jié)論。
5. 原代神經(jīng)球保留腫瘤代謝表型特征
實驗結(jié)果表明,膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GB)患者來源的原代神經(jīng)球在體外培養(yǎng)條件下仍能保留其體內(nèi)觀察到的三種代謝表型(糖酵解型、氧化型和混合型)。通過質(zhì)譜成像(MSI)分析顯示,神經(jīng)球的代謝特征與原始腫瘤組織高度一致,且不同代謝表型的神經(jīng)球在直徑大小、能量狀態(tài)(ATP/ADP比值)等方面無顯著差異(圖3a-e)。值得注意的是,來自同一腫瘤不同區(qū)域的神經(jīng)球(如GTP2 Med和GTP2 Lat)展現(xiàn)出與原始區(qū)域相匹配的代謝異質(zhì)性(圖3f,g)。此外,這些代謝表型在長期低氧(0.5% O₂)培養(yǎng)條件下仍保持穩(wěn)定,轉(zhuǎn)錄組分析未發(fā)現(xiàn)顯著變化。這些發(fā)現(xiàn)證實了GB代謝表型的細(xì)胞固有性和可塑性,表明其獨立于腫瘤微環(huán)境的影響,為后續(xù)體外研究和藥物篩選提供了可靠模型。
圖3 .原代神經(jīng)球模型重現(xiàn)GB患者的代謝表型特征
6. 神經(jīng)球代謝表型在大鼠腦中得以重現(xiàn)
實驗結(jié)果表明,體外培養(yǎng)的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GB)神經(jīng)球代謝表型在異種移植到大鼠腦內(nèi)后仍能穩(wěn)定維持。通過質(zhì)譜成像(MSI)分析顯示,AT8和S2細(xì)胞形成的移植瘤表現(xiàn)出高糖酵解活性([U-¹³C]乳酸標(biāo)記水平升高),而AT5移植瘤則呈現(xiàn)高氧化代謝特征([¹³C2]谷氨酸標(biāo)記水平升高)(圖4a,b)。這些代謝特征與原始神經(jīng)球表型完全一致,且不受移植瘤中細(xì)胞增殖(Ki67)、凋亡(CC3)或血管化(CD31)程度的影響。值得注意的是,先前研究顯示對放療更敏感的S2細(xì)胞在移植后表現(xiàn)出比A11細(xì)胞更強的TCA循環(huán)活性(圖4c,d),進一步驗證了代謝表型與治療響應(yīng)的相關(guān)性。這些結(jié)果證實了GB代謝表型的細(xì)胞固有性在體內(nèi)外環(huán)境中的穩(wěn)定性,為基于代謝分型的個性化治療研究提供了重要依據(jù)。
圖4 . 原位移植的神經(jīng)球保持其代謝特征,且這些特征與藥物反應(yīng)相關(guān)
7. 代謝表型在其他通路中呈現(xiàn)特征性差異
患者腫瘤組織切片中,氧化性區(qū)域的未標(biāo)記絲氨酸、蘇氨酸、谷氨酰胺及谷氨酸濃度顯著升高(ANOVA,Tukey檢驗P<0.05);神經(jīng)球模型中,未標(biāo)記亮氨酸/異亮氨酸、谷氨酰胺、谷氨酸、組氨酸和苯丙氨酸濃度亦顯著增高(ANOVA,Tukey檢驗P<0.005)。這與既往研究中氧化型GB細(xì)胞依賴脂肪酸氧化的特征相符。這些發(fā)現(xiàn)揭示了代謝表型與多種代謝通路之間的廣泛關(guān)聯(lián),為理解GB的代謝異質(zhì)性及其潛在治療靶點提供了新的分子層面的證據(jù)。
實驗結(jié)論
本研究通過高分辨率質(zhì)譜成像技術(shù),在人體膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GB)中實現(xiàn)了細(xì)胞代謝物同位素標(biāo)記的原位可視化分析,結(jié)合患者來源神經(jīng)球培養(yǎng)和原位移植瘤模型,系統(tǒng)證實了GB中存在三種由腫瘤細(xì)胞自身決定的固有代謝表型(糖酵解型、氧化型及混合型),這些表型基本獨立于腫瘤微環(huán)境(TME)的影響。
研究創(chuàng)新性地采用AVATAR低氧培養(yǎng)系統(tǒng)(0.5% O₂)對患者來源神經(jīng)球進行長達160小時的持續(xù)低氧培養(yǎng),發(fā)現(xiàn)其轉(zhuǎn)錄組特征和代謝表型保持高度穩(wěn)定,這一關(guān)鍵實驗證據(jù)直接證實了GB代謝表型的細(xì)胞自主性及其對低氧微環(huán)境的抵抗能力。值得注意的是,與肺癌等腫瘤不同,GB細(xì)胞的TCA循環(huán)活性與正常腦組織相當(dāng),且其代謝特征不受組織灌注差異的影響,其中氧化表型細(xì)胞對線粒體抑制劑和放療表現(xiàn)出顯著敏感性;诔瑯O化¹³C-MRI等先進代謝成像技術(shù)的臨床轉(zhuǎn)化潛力,本研究不僅為GB的分子分型提供了新的代謝標(biāo)志物,更開創(chuàng)了個體化治療的新范式:如針對氧化型腫瘤采用放療聯(lián)合線粒體抑制劑。AVATAR系統(tǒng)的成功應(yīng)用,為在可控低氧條件下研究腫瘤細(xì)胞的固有代謝特性建立了標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)平臺,對深入理解腫瘤代謝異質(zhì)性具有重要方法論意義。