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MicroRNA芯片分析
MicroRNA,芯片分析,miRNA靶標(biāo)基因的預(yù)測,miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
服務(wù)類別:芯片與生物信息學(xué)總訪問:1854
最后更新:2010-11-8半年訪問:8
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生數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化 (Raw data normalization)    對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,通過特定的統(tǒng)計(jì)分析,達(dá)到消除背景噪音,過濾臟數(shù)據(jù),去除同一實(shí)驗(yàn)不同block之間、不同芯片之間的實(shí)驗(yàn)誤差,使不同芯片的數(shù)據(jù)具有可比性。

差異表達(dá)分析 (DEG analysis)    差異表達(dá)分析是芯片數(shù)據(jù)的基本分析手段之一,不同方法適用于不同的數(shù)據(jù),常用的方法有l(wèi)imma,SAM,T-test ,F(xiàn)isher’s exact test等。

miRNA靶標(biāo)基因的預(yù)測(miRNA target prediction)   選取在十多種預(yù)測方法中至少有5種預(yù)測算法預(yù)測一致的靶基因


miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(miRNA regulation network)   基于MicroRNA的負(fù)調(diào)控屬性,選取顯著負(fù)相關(guān)的miRNA和gene進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)分析

 
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