人基因組表達(dá)譜芯片
(1)Human Genome U133 Plus 2.0 Array
代表人類全基因組47,000個(gè)轉(zhuǎn)錄本,代表了38,500個(gè)明晰的人類基因。
基于數(shù)據(jù)庫GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database(Build 159 January 25 2003)、Washington University EST trace repository、NCBI human genome assembly(Build 31)。
(2)Human Genome U133A 2.0 Array
U133A的升級(jí)版U133A2.0,涵蓋了18,400個(gè)轉(zhuǎn)錄本,代表了14,500明晰的基因。
包含有22,000個(gè)probe sets,具有5,00,000個(gè)寡核甘酸探針。
(3)Human Genome Focus Array
涵蓋了8,500多個(gè)明確的人類基因序列。均來自NCBI高質(zhì)量的RefSeq數(shù)據(jù)庫。
(4)Human X3P Array
專門為福爾馬林固定和石蠟包埋的樣本設(shè)計(jì)了一款X3P的全基因組芯片。代表了47,000個(gè)轉(zhuǎn)錄本,61,000探針組。
專門針對(duì)這種樣本降解比較嚴(yán)重的特點(diǎn),將探針集中設(shè)計(jì)在緊靠在3’端300個(gè)堿基的范圍內(nèi)。
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