蛋白互作是驗證基因或疾病作用機理不可或缺的一環(huán),常用的檢測方法有:酵母雙雜、串聯(lián)親和純化、co-IP、FRET、熒光蛋白(螢光素酶)融合等。不同的檢測方法各有優(yōu)勢,本期將介紹酵母雙雜的原理和優(yōu)勢。
· 酵母雙雜的原理 ·
酵母作為一種真核生物,其基因的轉(zhuǎn)錄需要反式作用因子的參與。反式作用因子GAL4由DNA結(jié)合域(BD)和轉(zhuǎn)錄激活域(AD)組成,完整的GAL4能結(jié)合至啟動子上游順式作用元件并啟動轉(zhuǎn)錄,導(dǎo)致下游基因的表達。
在構(gòu)建機制上,可將已知蛋白與BD構(gòu)建為融合蛋白,將待測蛋白和AD構(gòu)建為融合蛋白,若已知蛋白與待測蛋白存在相互作用,則兩者相互結(jié)合,導(dǎo)致BD與AD在空間上的距離非常相近,發(fā)揮完整的反式作用因子功能,啟動下游報告基因表達,可通過檢測報告基因的表達判斷蛋白的互作水平。
在實際應(yīng)用中,通常有大量商業(yè)化產(chǎn)品直接使用,如AH109菌株,其既不能產(chǎn)生GAL4,又是Trp和Leu缺陷型菌株,無法在營養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基中生長。當(dāng)兩種配套載體所表達的融合蛋白能夠相互作用時,完整的反式作用因子能夠激活酵母中基因表達,使得酵母可在營養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基上生長,達到篩選互作蛋白的功能。