歸巢核酸內(nèi)切酶的分類、特點(diǎn)及應(yīng)用
瀏覽次數(shù):32 發(fā)布日期:2025-8-4
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以人工核酸內(nèi)切酶介導(dǎo)的基因組編輯技術(shù)主要包括 4 種:歸巢核酸內(nèi)切酶技、 鋅指核酸酶技術(shù)、轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶技術(shù)和成簇的規(guī)律間隔的短回文重復(fù)序列CRISPR/Cas9 系統(tǒng)。
4 種主要的基因編輯技術(shù)
歸巢核酸內(nèi)切酶(Meganuclease)是一種天然存在的脫氧核糖核酸內(nèi)切酶,存在于各種形式的微生物以及真核生物的線粒體和葉綠體中,具有較大的 DNA 序列識別位點(diǎn) (14~40bp),該酶的切割位點(diǎn)在基因組中通常只出現(xiàn)一次。盡管自然界中存在數(shù)百種歸巢核酸內(nèi)切酶,但發(fā)現(xiàn)能夠在所需位置切割給定基因的歸巢核酸內(nèi)切酶的可能性非常小。
由于對 DNA 序列的識別位點(diǎn)較大,Meganuclease 具有高度的特異性,且自身編碼基因比較。▋H1 Kb 左右)易于傳遞。此外,該核酸酶切割 DNA 后會產(chǎn)生 3’端突出,更易進(jìn)行 HDR 重組。然而, Meganuclease 的 DNA 結(jié)合域和裂解域不易區(qū)分,設(shè)計(jì)上較困難。
根據(jù)氨基酸序列和結(jié)構(gòu)域特征,歸巢核酸內(nèi)切酶可分為 6 個(gè)主要家族,各家族特點(diǎn)如下:
- LAGLIDADG 家族:最常見的家族,名稱來自其保守的氨基酸基序(LAGLIDADG),通常以同源二聚體(切割回文序列)或單體(切割非回文序列)形式發(fā)揮作用,如 I-SceI(來自酵母線粒體內(nèi)含子)。
- GIY-YIG 家族:含保守的 GIY-YIG 基序,多為單體酶,識別序列長度約 14-20 bp,如 I-TevI(來自噬菌體 T4)。
- HNH 家族:含 HNH 基序(組氨酸 - 天冬酰胺 - 組氨酸),依賴金屬離子(如 Mg²⁺)切割 DNA,如 I-HmuI。
- His-Cys 盒家族:含保守的 His-Cys 基序,多與真核生物線粒體內(nèi)含子相關(guān)。
- PD-(D/E) XK 家族:與部分限制性內(nèi)切酶共享保守基序,但識別序列更長,如 I-PpoI。
- Vsr-like 家族:較少見,結(jié)構(gòu)與 Vsr(very short patch repair)修復(fù)酶相關(guān)。
由于歸巢核酸內(nèi)切酶具有長識別序列、高特異性的特點(diǎn),其在基因編輯領(lǐng)域具有重要應(yīng)用潛力:
- 精準(zhǔn)基因切割:可作為基因編輯工具,在特定長序列處切割 DNA,減少脫靶效應(yīng)(如 I-SceI 常被用于驗(yàn)證基因修復(fù)效率)。
- 基因驅(qū)動(dòng)系統(tǒng):通過改造歸巢核酸內(nèi)切酶,可構(gòu)建基因驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)(如在蚊子中傳播抗瘧基因),實(shí)現(xiàn)特定基因在種群中的快速擴(kuò)散。
- 基因治療:可用于靶向切割致病基因(如病毒整合序列、突變基因),結(jié)合修復(fù)模板實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)修復(fù)。