方案摘要:本方案聚焦 Pipetty 電動(dòng)移液器在動(dòng)物布魯氏菌病熒光 RAA(重組酶介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增)檢測(cè)中的應(yīng)用,通過(guò)精準(zhǔn)移液、高效分液與智能操作三大核心優(yōu)勢(shì),顯著提升檢測(cè)效率與準(zhǔn)確性。Pipetty 憑借高精度移液及溫度補(bǔ)償功能,確保反應(yīng)體系中引物、探針等關(guān)鍵試劑添加量的一致性,有效降低假陰性與假陽(yáng)性率;其連續(xù)分液模式可使 96 孔板操作時(shí)間縮短 80%,為動(dòng)物疫病快速診斷提供標(biāo)準(zhǔn)化、可追溯的解決方案,尤其適用于基層獸醫(yī)站、海關(guān)口岸等檢測(cè)場(chǎng)景。
方案詳情:
一、實(shí)驗(yàn)原理
動(dòng)物布魯氏菌病熒光 RAA 檢測(cè)基于重組酶介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。在 37-42℃恒溫下,重組酶與引物結(jié)合形成復(fù)合物,識(shí)別并結(jié)合布魯氏菌 DNA 模板,解開(kāi)雙鏈啟動(dòng)擴(kuò)增;單鏈結(jié)合蛋白穩(wěn)定單鏈結(jié)構(gòu),鏈置換 DNA 聚合酶延伸新鏈,實(shí)現(xiàn)指數(shù)級(jí)擴(kuò)增。引物或探針標(biāo)記熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán),擴(kuò)增過(guò)程中熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,釋放熒光信號(hào),通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)熒光強(qiáng)度判斷樣本中是否存在布魯氏菌 DNA,實(shí)現(xiàn)快速、靈敏檢測(cè)。
二、
實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備
1、設(shè)配和材料
① Ⅱ級(jí)生物安全柜。
② 干式加熱器。
③ 水浴鍋。
④ 熒光 PCR 擴(kuò)增儀及配套 PCR 管。
⑤ 臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)(離心力≥12000g)。
⑥ 冰箱(2 ℃~8 ℃、-20 ℃,-80 ℃)。
⑦ Pipetty電動(dòng)移液器0.1-20 μL、1-250 μL、5-1000 μL)及無(wú)菌槍頭。
⑧ 恒溫?zé)晒饣驒z測(cè)儀及配套反應(yīng)管。
⑨ 樣品前處理系統(tǒng)。
2、試劑和材料
① 熒光基礎(chǔ)反應(yīng)單元(含重組酶,單鏈結(jié)合蛋白和 DNA 聚合酶的凍干粉)及配套緩沖液。
② 乙酸鎂(140 mmol/L)。
③ 陽(yáng)性對(duì)照,為參考菌株(牛種、羊種、豬種、犬種布魯氏菌基因組以及 A19 和 S2 疫苗株等) DNA,可使用 10
2 CFU/mL~10
3 CFU/mL 的細(xì)菌 200 μL 提取細(xì)菌DNA。
④ 陰性對(duì)照,為 ddH
2O。
三、實(shí)驗(yàn)步驟
1、疑似布魯氏菌分離株的滅活:在生物安全柜內(nèi),用接種環(huán)從培養(yǎng)皿上挑取單個(gè)疑似菌落或多個(gè)經(jīng)純培養(yǎng)的疑似菌落,加入含 200 uL的 PBS 或 ddH
2O 的離心管中,使用Pipetty電動(dòng)移液器,設(shè)置自動(dòng)混勻功能,吹打均勻,密封管蓋,置于干式加熱器,80 ℃滅活 2h。
2、將全血樣 、乳樣、組織樣、拭子樣及液體樣,進(jìn)行處理后,置于干式加熱器或水浴鍋,80 ℃滅活2 h。
3、菌株及樣品 DNA提取,可采用細(xì)菌 DNA 提取試劑盒,按說(shuō)明書(shū)規(guī)定程序提取樣品 DNA,也可采用酚-三氯甲烷-異戊醇抽提法,步驟如下:
a)使用Pipetty電動(dòng)移液器取 200 μL 處理過(guò)的樣品放入離心管,加入裂解液(10 mmol/L EDTA,150 mmol/L NaC1,0.5% SDS,200 μg/ml 蛋白酶K)200μL,56 ℃消化2h,12000g離心 20s,取上清液置于另一個(gè)管中,然后加入等體積的酚-三氯甲烷-異戊醇(25:24:1)混合物,上下顛倒3~4次混勻。
b)4℃ 7000g離心10 min,移上層液相置于另一個(gè)管中,加入 2.5倍體積預(yù)冷 70%(體積分?jǐn)?shù))乙醇,-20 ℃沉淀 30 min,12000g離心10 min,棄去液相,加入1mL 70%(體積分?jǐn)?shù))乙醇漂洗,12000g 離心 2 min~3 min,棄去液相,留取沉淀,真空或室溫干燥,加入 20μL ddH
2O,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?br />
4、按表2配制RAA反應(yīng)混合液。
5、將 40 μLRAA 反應(yīng)混合液加入 RAA 熒光基礎(chǔ)反應(yīng)單元管中。
6、將 5μL 乙酸鎂(反應(yīng)催化劑)加在反應(yīng)單元管蓋內(nèi)側(cè)。
7、向反應(yīng)單元管中依次加入 5μL 待測(cè)核酸,最后扣緊反應(yīng)單元管蓋。
8、將反應(yīng)單元管置于樣品前處理系統(tǒng)中,39 ℃下按程序運(yùn)行 4 min。
9、將反應(yīng)單元管放入恒溫核酸擴(kuò)增檢測(cè)儀,設(shè)置擴(kuò)增溫度為 39 ℃,擴(kuò)增時(shí)間 30 min,每隔 20s收集熒光信號(hào)。注:樣品前處理系統(tǒng)和恒溫核酸擴(kuò)增檢測(cè)儀提前 30 min預(yù)熱。
四、結(jié)果判定
1、同時(shí)滿(mǎn)足以下條件,可判定試驗(yàn)成立,否則應(yīng)重新試驗(yàn)。
a)陽(yáng)性對(duì)照出現(xiàn)特異性擴(kuò)增曲線(xiàn),擴(kuò)增曲線(xiàn)的斜率K≥20;
b)陰性對(duì)照無(wú)特異性擴(kuò)增曲線(xiàn),擴(kuò)增曲線(xiàn)的斜率K<20。
2、在滿(mǎn)足上述的條件下,當(dāng)樣品擴(kuò)增曲線(xiàn)的斜率 K≥20 時(shí),可判為陽(yáng)性,否則判為陰性。