百趣生物年度重磅升級：發(fā)現(xiàn)代謝組學HD

近日，我們針對親水和MIX兩大體系完成了升級，隨機對血清、尿液、動物組織、植物組織等多種樣本類型進行了實測。
升級后的「發(fā)現(xiàn)代謝組學HD-親水版」，物質檢出數(shù)量平均為升級前的241%，物質定性數(shù)量為139%。以人血清樣本為例，物質檢出數(shù)量平均提升了96%，物質定性數(shù)量平均提升了29%。
 

升級后的「發(fā)現(xiàn)代謝組學HD-MIX版」，物質檢出數(shù)量平均為升級前的193%，物質定性數(shù)量為134%。以小鼠血清樣本為例，物質檢出數(shù)量平均提升57%，物質定性數(shù)量平均提升75%。
 

B(i)級別可靠鑒定代謝物20%
配合最新優(yōu)化升級的數(shù)據(jù)庫，參考2021年最新NATURE METHODS（IF=28.547）^[1]對代謝物的鑒定級別進行了注釋，「發(fā)現(xiàn)代謝組學HD」系列產(chǎn)品各種類型樣本B(i)級別鑒定代謝物平均占比可達到20%�；�于非靶向技術的核心優(yōu)勢，隨著數(shù)據(jù)庫的迭代升級，可以對已檢出的數(shù)據(jù)進行反復挖掘，對未知物進行更深度的注釋及提高物質鑒定的可靠性。
(P.S.BIOTREE對「發(fā)現(xiàn)代謝組學HD」系列產(chǎn)品提供免費數(shù)據(jù)再次挖掘服務)
 

發(fā)現(xiàn)代謝組學HD兩大升級

1. 儀器性能的提升
使用Thermo Orbitrap Exploris 120高分辨質譜儀器平臺，在性能和質量精度方面都有很大提升，從而采集到更多的代謝物信號。
 

2.數(shù)據(jù)庫的升級
為了充分利用代謝組學數(shù)據(jù)，我們需要在不同的實驗室之間進行可比性�？紤]到不同技術手段產(chǎn)出的數(shù)據(jù)存在差異，在發(fā)表的論文中，需要標明物質注釋的相關信息，其中代謝物注釋的可靠等級尤為重要，BIOTREE對數(shù)據(jù)庫進行了全面的升級提供了代謝物注釋的分類等級，「發(fā)現(xiàn)代謝組學HD」系列產(chǎn)品可以提供達到B(i)級別的代謝物鑒定。

參考上文提到的NATURE METHODS建議，代謝物鑒定級別：
A 標準品靶向驗證或NMR鑒定
B(i) 基于標品數(shù)據(jù)庫MS/MS 的可靠匹配
B(ii) 基于模擬數(shù)據(jù)庫 MS/MS 的可靠匹配
B(iii) 基于MS/MS 的部分匹配
C(i ) 基于標品數(shù)據(jù)庫MSn 的可靠匹配
C(ii) 基于模擬數(shù)據(jù)庫 MSn 的可靠匹配
C(iii) 基于 MSn 的部分匹配
D 基于MS的匹配

參考文獻
[1] Alseekh S, Aharoni A, Brotman Y, et al. Mass spectrometry-based metabolomics: a guide for annotation, quantification and best reporting practices. Nat Methods. 2021 Jul;18(7):747-756. doi: 10.1038/s41592-021-01197-1. Epub 2021 Jul 8. PMID: 34239102.