PCR 的特異性主要決定因素及提高方法
聚合酶鏈式反應(yīng)（PCR）是一種用于放大擴增特定的DNA片段的分子生物學技術(shù)，它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制，PCR的最大特點是能將微量的DNA以指數(shù)型大幅增加，特異性強。
PCR 的特異性主要決定因素及提高的五大方法：
PCR 的特異性主要決定因素：
1、引物。引物的結(jié)構(gòu)和長度是PCR特異性的關(guān)鍵。此外，引物濃度過高會增大形成引物二聚體的概率，從而降低PCR特異性。
2、復(fù)性溫度。在Tm值允許范圍內(nèi)，選擇較高的復(fù)性溫度可大大減少引物和模板間的非特異性結(jié)合，提高PCR反應(yīng)的特異性。
3、延伸時間。延伸時間過長會導(dǎo)致非特異性擴增帶的出現(xiàn)。
4、Mg2+濃度。Mg2+濃度對PCR擴增的特異性有顯著影響。Mg2+濃度過高時，容易出現(xiàn)非特異性擴增，使反應(yīng)特異性降低。
5、DNA聚合酶的種類和數(shù)量。不同種類的酶對PCR特異性的影響程度不同；酶的量過多更容易引起非特異性擴增。
PCR 反應(yīng)特異性提高的五大方法：
PCR 的特異性主要決定因素及提高的五大方法：
PCR 的特異性主要決定因素：
1、引物。引物的結(jié)構(gòu)和長度是PCR特異性的關(guān)鍵。此外，引物濃度過高會增大形成引物二聚體的概率，從而降低PCR特異性。
2、復(fù)性溫度。在Tm值允許范圍內(nèi)，選擇較高的復(fù)性溫度可大大減少引物和模板間的非特異性結(jié)合，提高PCR反應(yīng)的特異性。
3、延伸時間。延伸時間過長會導(dǎo)致非特異性擴增帶的出現(xiàn)。
4、Mg2+濃度。Mg2+濃度對PCR擴增的特異性有顯著影響。Mg2+濃度過高時，容易出現(xiàn)非特異性擴增，使反應(yīng)特異性降低。
5、DNA聚合酶的種類和數(shù)量。不同種類的酶對PCR特異性的影響程度不同；酶的量過多更容易引起非特異性擴增。
PCR 反應(yīng)特異性提高的五大方法：
1. 引物的設(shè)計
引物最好在模板 cDNA 的保守區(qū)設(shè)計，長度 15-30bp，GC 含量小于 60%，3’端不超過連續(xù)三個 G 或 C，堿基分
布錯落有致，避免引物自身形成二聚體，設(shè)計完成之后，需進行 BLAST 檢測，如果與其他基因不具有互補性，則可以進行下一步實驗。
2. 降落 PCR
降落 PCR 是一種簡單的降低非特異性產(chǎn)物的 PCR，最大的優(yōu)點就是可以降低實驗耗時，同時又可以優(yōu)化實驗的步驟。引物的設(shè)計決定退火溫度，退火溫度過高會使 PCR 效率過低，過低則會使非特異擴增過多。這雖然可以通過反復(fù)嘗試來優(yōu)化，但費時費力。降落 PCR 提供了一個較為簡易的優(yōu)化方法。首先在較高的溫度下擴增，此時雖然擴增效率低，但非特異擴增基本沒有。隨著退火溫度的降低，非特異擴增會逐步增多。但由于此時特異的擴增產(chǎn)物已經(jīng)達到一定的數(shù)量優(yōu)勢，因此會對非特異擴增產(chǎn)生強烈的競爭抑制，從而大幅提高 PCR 的特異性和效率。
3. 熱啟動擴增
采用熱啟動方法進行擴增，是除了設(shè)計最佳引物之外，提高 PCR 反應(yīng)特異性好的方式。在一般的 PCR 反應(yīng)中，試劑的配置需在冰上進行，且要將 PCR 儀預(yù)熱，這種方法就類似于熱啟動，能夠一定程度的抑制錯配。但是酶在低溫下也存在活性，只要體系中有 DNA 鏈存在，就會擴增產(chǎn)生非特異性條帶。采用熱啟動的方法就是在達到變性溫度之前wan全抑制酶的活性，而zui有效的方法就是使用熱啟動 Taq 酶(或熱啟動高保真聚合酶)去擴增，它的原理就是采用化學修飾的方法封閉酶的活性中心，當溫度上升到 95℃時恢復(fù)活性，指導(dǎo)擴增。
4. 巢式 PCR
采用巢式 PCR 進行擴增，在多輪擴增結(jié)果中提高擴增特異性和靈敏度。與普通 PCR 不同的是，它采用兩對引物進行擴增，首先用第一對引物普通 PCR，然后將第一輪擴增的產(chǎn)物稀釋 100 倍后用第二對引物(巢式引物)二次擴增。因此采用巢式 PCR 可以大大增加困難模板擴增的特異性和有限靶序列的靈敏度。
- DNA與DNA酶的調(diào)控機制、功能及兩者的協(xié)同作用
- 核酸內(nèi)切酶DNase I的結(jié)構(gòu)、功能與多元應(yīng)用
- DLL3配體的結(jié)構(gòu)、功能機制及在肺癌治療與腫瘤研究中的作用
- FLAG親和標簽的結(jié)構(gòu)、優(yōu)勢及精準去除方法
- 睡眠壓力的線粒體起源及大腦中分子變化與睡眠需求的關(guān)聯(lián)
- pHSense™ Eu探針相比傳統(tǒng)GPCR的優(yōu)勢及技術(shù)原理
- Puromycin(嘌呤霉素)的作用機制及在轉(zhuǎn)染篩選、動物造模中的應(yīng)用
- bFGF(FGF-2)的特性、信號通路及在細胞培養(yǎng)、類器官培養(yǎng)等方面的應(yīng)用
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網(wǎng) 電話：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com