在細(xì)胞內(nèi),蛋白質(zhì)的合成是一個(gè)極其復(fù)雜且高度有序的過(guò)程,而
Puromycin(嘌呤霉素,AbMole,M3637)就如同一個(gè) “搗亂分子”可以干擾這一關(guān)鍵進(jìn)程。它的作用靶點(diǎn)主要是核糖體,通過(guò)模擬氨; tRNA(aa-tRNA)的 3' 末端結(jié)構(gòu),巧妙地混入蛋白質(zhì)合成的 “生產(chǎn)線” 中。正常情況下,氨; tRNA 攜帶特定的氨基酸進(jìn)入核糖體的 A 位點(diǎn),參與肽鏈的延伸。而嘌呤霉素由于其結(jié)構(gòu)與氨酰化tRNA的3'末端極為相似,能夠以假亂真,代替正常的氨基酸進(jìn)入核糖體。一旦Puromycin
Puromycin(嘌呤霉素)進(jìn)入核糖體的A位點(diǎn),核糖體肽基轉(zhuǎn)移酶中心(PTC)就會(huì)將其催化摻入到新生肽鏈的C末端。然而,嘌呤霉素畢竟不是真正的氨基酸,它無(wú)法像正常的氨; tRNA 那樣參與后續(xù)的肽鏈延伸反應(yīng)。這就如同在一條生產(chǎn)線上,突然混入了一個(gè)不符合標(biāo)準(zhǔn)的零件,導(dǎo)致整個(gè)生產(chǎn)流程被迫中斷,翻譯過(guò)程過(guò)早終止[1]。

圖 1. Puromycin的作用機(jī)理[1]
翻譯水平的調(diào)節(jié)是重要的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制之一,涉及mRNA 翻譯因子、核糖體蛋白、RNA 結(jié)合蛋白和非編碼 RNA 的表達(dá)以及
RNA 二級(jí)結(jié)構(gòu)、
RNA甲基化和
上游開(kāi)放閱讀框選擇的調(diào)節(jié)變化。
Puromycin(嘌呤霉素,AbMole,M3637)是一種研究蛋白翻譯的重要工具,當(dāng)在細(xì)胞培養(yǎng)體系中以低濃度加入嘌呤霉素時(shí),它能夠特異性地?fù)饺氲叫潞铣傻碾逆溨。這一過(guò)程就像是給上述肽鏈貼上了一個(gè)特殊的“標(biāo)簽”,科研人員可以通過(guò)追蹤這個(gè) “標(biāo)簽” 來(lái)了解蛋白質(zhì)合成的動(dòng)態(tài)過(guò)程,通過(guò)可以特異性識(shí)別Puromycin的抗體進(jìn)行免疫印記和免疫熒光等方式檢測(cè)蛋白翻譯的動(dòng)態(tài)過(guò)程。此外,基于嘌呤霉素的檢測(cè)與鄰位連接 (PLA) 檢測(cè)的結(jié)合(Puro-PLA),實(shí)驗(yàn)人員可以檢測(cè)特異性 mRNA 的翻譯。Puro-PLA:目的蛋白抗體和Puromycin的抗體各帶有一段可以互補(bǔ)的核苷酸序列,當(dāng)Puromycin作用于目的肽鏈上時(shí),與目的蛋白的新生肽鏈間距較近,隨后加入上述兩種抗體,此時(shí)上述的兩段核苷酸就會(huì)互補(bǔ)配對(duì),隨后通過(guò)滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)產(chǎn)生可檢測(cè)的信號(hào)。


圖 2. Puro-PLA的工作原理
3. 構(gòu)建動(dòng)物腎病模型
Puromycin(嘌呤霉素,AbMole,M3637)在構(gòu)建動(dòng)物模型,尤其是腎病模型方面,有著重要的應(yīng)用。以構(gòu)建腎病動(dòng)物模型為例,嘌呤霉素能夠直接損傷腎小球上皮細(xì)胞。當(dāng)給實(shí)驗(yàn)動(dòng)物(如大鼠)注射嘌呤霉素后,它會(huì)作用于腎小球上皮細(xì)胞,使細(xì)胞骨架、細(xì)胞外基質(zhì)蛋白、細(xì)胞表面整合素、硫酸化蛋白聚糖等物質(zhì)發(fā)生結(jié)構(gòu)和功能變化。同時(shí),嘌呤霉素還會(huì)誘導(dǎo)腎小球固有細(xì)胞產(chǎn)生自由基,這些自由基會(huì)進(jìn)一步破壞腎小球?yàn)V過(guò)膜,導(dǎo)致腎小球?yàn)V過(guò)膜的分子屏障功能降低。因此嘌呤霉素是一款經(jīng)典的動(dòng)物腎病實(shí)驗(yàn)造模劑[2]。
三、范例詳解
1. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis.
科研人員構(gòu)建了一個(gè)熒光素酶 (Gluc) 報(bào)告基因檢測(cè)系統(tǒng),以從中藥配方SNS 中鑒定具有抗 I 型 IFN 活性的成分。并在 RAW264.7 細(xì)胞中,采用實(shí)時(shí) PCR (RT-PCR) 和 Western blotting 研究 I 型 IFN 通路的變化。此外,在博來(lái)霉素 (BLM,AbMole,M13641)誘導(dǎo)的小鼠硬化癥模型中,通過(guò) RT-PCR 測(cè)量纖維化基因、I 型 IFN 相關(guān)基因、炎性細(xì)胞因子的表達(dá),并通過(guò) H&E 染色、Masson 染色和免疫組織化學(xué)分析確定組織病理學(xué)變化。最終結(jié)果表明芍藥總葡萄糖苷 (TGP) 是 SNS 的生物活性成分,它選擇性抑制 TLR3 介導(dǎo)的 I 型 IFN 反應(yīng),并阻斷 I 型 IFN 誘導(dǎo)的下游 JAK-STAT 信號(hào)通路。在動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,TGP 通過(guò)抑制 I 型 IFN 信號(hào)傳導(dǎo)上游和下游的多個(gè)靶點(diǎn)來(lái)改善皮膚纖維化。在構(gòu)建熒光素酶檢測(cè)系統(tǒng)中,科研人員使用了由AbMole提供的
Puromycin(嘌呤霉素,AbMole,M3637)用于細(xì)胞轉(zhuǎn)染后的篩選[3]。


圖 3. Establishment of Gluc reporter assay system and identification of ingredients with anti-type I IFN activities[3].
2. Transl Oncol. 2023 Feb;28:101617.
科研人員在上述文章中探究了結(jié)直腸癌(CRC)對(duì)奧沙利鉑(Oxaliplatin,AbMole,M2290)產(chǎn)生耐受性的機(jī)制,在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)了KIAA1199 可以促進(jìn) CRC 的奧沙利鉑耐藥。從機(jī)制上講,KIAA1199 可以通過(guò)連接O-GlcNAc 轉(zhuǎn)移酶(OGT)和底物蛋白來(lái)促進(jìn)蛋白質(zhì)的O-GlcNAcylation ,進(jìn)而可減輕內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激 (ERS) 并防止 CRC 細(xì)胞凋亡。同時(shí),KIAA1199 還可以通過(guò) O-GlcNAcylation穩(wěn)定SNAI1蛋白來(lái)觸發(fā)上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化,促進(jìn)CRC的轉(zhuǎn)移。在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中,科研人員還構(gòu)建了KIAA1199和OGT敲低的穩(wěn)定轉(zhuǎn)染SW480 和HCT116細(xì)胞,在篩選中使用了來(lái)自AbMole的
Puromycin(嘌呤霉素,AbMole,M3637)[4]。


圖 4. Inhibition of PARP1 by olaparib reverses oxaliplatin resistance of CRC[4].
AbMole是ChemBridge中國(guó)區(qū)官方指定合作伙伴。

參考文獻(xiàn)及鳴謝
[1] D. Zhang, Y. Gao, L. Zhu, et al., Advances and opportunities in methods to study protein translation - A review, Int J Biol Macromol 259(Pt 1) (2024) 129150.
[2] M. Xiao, B. N. Bohnert, F. Grahammer, et al., Rodent models to study sodium retention in experimental nephrotic syndrome, Acta physiologica (Oxford, England) 235(3) (2022) e13844.
[3] M. Wang, Y. Bai, D. Jiang, et al., A novel HOIP frameshift variant alleviates NF-kappaB signalling and sensitizes cells to TNF-induced death, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease 1870(7) (2024) 167355.
[4] Q. Hua, Y. Lu, D. Wang, et al., KIAA1199 promotes oxaliplatin resistance and epithelial mesenchymal transition of colorectal cancer via protein O-GlcNAcylation, Translational oncology 28 (2023) 101617.