在細胞內(nèi),蛋白質(zhì)的合成是一個極其復雜且高度有序的過程,而
Puromycin(嘌呤霉素,AbMole,M3637)就如同一個 “搗亂分子”可以干擾這一關(guān)鍵進程。它的作用靶點主要是核糖體,通過模擬氨; tRNA(aa-tRNA)的 3' 末端結(jié)構(gòu),巧妙地混入蛋白質(zhì)合成的 “生產(chǎn)線” 中。正常情況下,氨; tRNA 攜帶特定的氨基酸進入核糖體的 A 位點,參與肽鏈的延伸。而嘌呤霉素由于其結(jié)構(gòu)與氨;痶RNA的3'末端極為相似,能夠以假亂真,代替正常的氨基酸進入核糖體。一旦Puromycin
Puromycin(嘌呤霉素)進入核糖體的A位點,核糖體肽基轉(zhuǎn)移酶中心(PTC)就會將其催化摻入到新生肽鏈的C末端。然而,嘌呤霉素畢竟不是真正的氨基酸,它無法像正常的氨; tRNA 那樣參與后續(xù)的肽鏈延伸反應。這就如同在一條生產(chǎn)線上,突然混入了一個不符合標準的零件,導致整個生產(chǎn)流程被迫中斷,翻譯過程過早終止[1]。

圖 1. Puromycin的作用機理[1]
翻譯水平的調(diào)節(jié)是重要的基因表達調(diào)控機制之一,涉及mRNA 翻譯因子、核糖體蛋白、RNA 結(jié)合蛋白和非編碼 RNA 的表達以及
RNA 二級結(jié)構(gòu)、
RNA甲基化和
上游開放閱讀框選擇的調(diào)節(jié)變化。
Puromycin(嘌呤霉素,AbMole,M3637)是一種研究蛋白翻譯的重要工具,當在細胞培養(yǎng)體系中以低濃度加入嘌呤霉素時,它能夠特異性地摻入到新合成的肽鏈中。這一過程就像是給上述肽鏈貼上了一個特殊的“標簽”,科研人員可以通過追蹤這個 “標簽” 來了解蛋白質(zhì)合成的動態(tài)過程,通過可以特異性識別Puromycin的抗體進行免疫印記和免疫熒光等方式檢測蛋白翻譯的動態(tài)過程。此外,基于嘌呤霉素的檢測與鄰位連接 (PLA) 檢測的結(jié)合(Puro-PLA),實驗人員可以檢測特異性 mRNA 的翻譯。Puro-PLA:目的蛋白抗體和Puromycin的抗體各帶有一段可以互補的核苷酸序列,當Puromycin作用于目的肽鏈上時,與目的蛋白的新生肽鏈間距較近,隨后加入上述兩種抗體,此時上述的兩段核苷酸就會互補配對,隨后通過滾環(huán)擴增(RCA)產(chǎn)生可檢測的信號。


圖 2. Puro-PLA的工作原理
3. 構(gòu)建動物腎病模型
Puromycin(嘌呤霉素,AbMole,M3637)在構(gòu)建動物模型,尤其是腎病模型方面,有著重要的應用。以構(gòu)建腎病動物模型為例,嘌呤霉素能夠直接損傷腎小球上皮細胞。當給實驗動物(如大鼠)注射嘌呤霉素后,它會作用于腎小球上皮細胞,使細胞骨架、細胞外基質(zhì)蛋白、細胞表面整合素、硫酸化蛋白聚糖等物質(zhì)發(fā)生結(jié)構(gòu)和功能變化。同時,嘌呤霉素還會誘導腎小球固有細胞產(chǎn)生自由基,這些自由基會進一步破壞腎小球濾過膜,導致腎小球濾過膜的分子屏障功能降低。因此嘌呤霉素是一款經(jīng)典的動物腎病實驗造模劑[2]。
三、范例詳解
1. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis.
科研人員構(gòu)建了一個熒光素酶 (Gluc) 報告基因檢測系統(tǒng),以從中藥配方SNS 中鑒定具有抗 I 型 IFN 活性的成分。并在 RAW264.7 細胞中,采用實時 PCR (RT-PCR) 和 Western blotting 研究 I 型 IFN 通路的變化。此外,在博來霉素 (BLM,AbMole,M13641)誘導的小鼠硬化癥模型中,通過 RT-PCR 測量纖維化基因、I 型 IFN 相關(guān)基因、炎性細胞因子的表達,并通過 H&E 染色、Masson 染色和免疫組織化學分析確定組織病理學變化。最終結(jié)果表明芍藥總葡萄糖苷 (TGP) 是 SNS 的生物活性成分,它選擇性抑制 TLR3 介導的 I 型 IFN 反應,并阻斷 I 型 IFN 誘導的下游 JAK-STAT 信號通路。在動物實驗中,TGP 通過抑制 I 型 IFN 信號傳導上游和下游的多個靶點來改善皮膚纖維化。在構(gòu)建熒光素酶檢測系統(tǒng)中,科研人員使用了由AbMole提供的
Puromycin(嘌呤霉素,AbMole,M3637)用于細胞轉(zhuǎn)染后的篩選[3]。


圖 3. Establishment of Gluc reporter assay system and identification of ingredients with anti-type I IFN activities[3].
2. Transl Oncol. 2023 Feb;28:101617.
科研人員在上述文章中探究了結(jié)直腸癌(CRC)對奧沙利鉑(Oxaliplatin,AbMole,M2290)產(chǎn)生耐受性的機制,在實驗中發(fā)現(xiàn)了KIAA1199 可以促進 CRC 的奧沙利鉑耐藥。從機制上講,KIAA1199 可以通過連接O-GlcNAc 轉(zhuǎn)移酶(OGT)和底物蛋白來促進蛋白質(zhì)的O-GlcNAcylation ,進而可減輕內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激 (ERS) 并防止 CRC 細胞凋亡。同時,KIAA1199 還可以通過 O-GlcNAcylation穩(wěn)定SNAI1蛋白來觸發(fā)上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化,促進CRC的轉(zhuǎn)移。在實驗設(shè)計中,科研人員還構(gòu)建了KIAA1199和OGT敲低的穩(wěn)定轉(zhuǎn)染SW480 和HCT116細胞,在篩選中使用了來自AbMole的
Puromycin(嘌呤霉素,AbMole,M3637)[4]。


圖 4. Inhibition of PARP1 by olaparib reverses oxaliplatin resistance of CRC[4].
AbMole是ChemBridge中國區(qū)官方指定合作伙伴。

參考文獻及鳴謝
[1] D. Zhang, Y. Gao, L. Zhu, et al., Advances and opportunities in methods to study protein translation - A review, Int J Biol Macromol 259(Pt 1) (2024) 129150.
[2] M. Xiao, B. N. Bohnert, F. Grahammer, et al., Rodent models to study sodium retention in experimental nephrotic syndrome, Acta physiologica (Oxford, England) 235(3) (2022) e13844.
[3] M. Wang, Y. Bai, D. Jiang, et al., A novel HOIP frameshift variant alleviates NF-kappaB signalling and sensitizes cells to TNF-induced death, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease 1870(7) (2024) 167355.
[4] Q. Hua, Y. Lu, D. Wang, et al., KIAA1199 promotes oxaliplatin resistance and epithelial mesenchymal transition of colorectal cancer via protein O-GlcNAcylation, Translational oncology 28 (2023) 101617.